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熒光原位雜交是在放射性原位雜交技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展起來的一種非放射性分子生物學(xué)和細胞遺傳學(xué)結(jié)合的新技術(shù)，是一種重要的非放射性原位雜交技術(shù)，原理是利用報告分子（如生物素、地高辛等）標記核酸探針，然后將探針與染色體或DNA纖維切片上的靶DNA雜交，若兩者同源互補，即可形成靶DNA與核酸探針的雜交體。此時可利用該報告分子與熒光素標記的特異親和素之間的免疫化學(xué)反應(yīng)，經(jīng)熒光檢測體系在鏡下對待DNA進行定性、定量或相對定位分析。
目前被廣泛應(yīng)用于染色體畸變。如非整倍體、染色體重組。其基本流程包括探針標記、探針的變性、樣本變性、雜交和熒光信號采集。